1948（昭和23）年、各町村にあった既存の農業会が解散しそれを改組する形で新しく発足した組織。しかし、零細な単一農協では経営が苦しく、基盤の確立と経営合理化を図るため1964（昭和39）年に、美濃加茂市内８農協が合併し、美濃加茂市農協となった。合併時の組合員数は3,154人であった。農協は1992（平成4）年から愛称「ＪＡ」となる。2003年に中濃地域を管轄する5つの農協（JA中濃、JA郡上、JAおくみの、JAみのかも、JA可児）が合併して「めぐみの農業協同組合（JAめぐみの）」となった。