1873(明治6)年、上蜂屋村の瑞林寺に開校した性研義校が前身である。通学区域は、上蜂屋村、中蜂屋村、下蜂屋村、伊瀬村であった。1885(明治18)年に蜂屋学校となった。その後、学校令により1886（明治19）年に尋常小学校になり、高等科設置の政策により1898(明治31)年には蜂屋尋常高等小学校となる。翌1900（明治33）年に校舎が移転新築された。1936（昭和11）年に改築がされる。1941（昭和16）年、国民学校令の公布により蜂屋国民学校と改称された。