1863(文久3)年、現在の愛知県岡崎市に生まれる。札幌農学校（現北海道大学）を卒業後、雑誌「日本人」の創刊に参加。1894(明治27)年発刊の『日本風景論』は、わずか2カ月で完売するほどの人気で志賀は広くその名を知られた。1913(大正2)年5月、岐阜県加茂郡教育会が主催する加茂農林学校（加茂郡古井町・大正元年開校）での講演のため、美濃加茂を訪れた際、犬山までを往復した。その時に犬山城下の木曽川の光景を高く評価し、ドイツのライン川と絶賛した。このことが「日本ライン」の名称の誕生となった。1927(昭和2)年、63歳で没。太田の祐泉寺に墓がある。